Der gängigste Motor für BHKWs ist der Gasmotor, der mit Flüssig-, Erd- oder Biogas betrieben werden kann. Hierbei handelt es sich um eine solide und hochentwickelte Technologie, die mit Wirkungsgraden von teilweise über 90 Prozent sehr effizient und ressourcenschonend arbeitet.
Neben dem Gasmotor kommt auch der Stirling-Motor in BHKWs zum Einsatz, der - anders als der Verbrennungsmotor - von außen beheizt wird. Da die Verbrennung außerhalb stattfindet, kann eine Vielzahl von Brennstoffen genutzt werden, darunter auch Biomasse wie beispielweise Holzpellets. Ein Stirling-Motor ist leiser, abgasärmer, vibrationsärmer und wartungsärmer als ein Verbrennungsmotor.
Als eine der momentan innovativsten Technologien in der Wärme- und Stromerzeugung, bilden Brennstoffzellen eine neue Alternative zu herkömmlichen Motoren. Eine Brennstoffzelle wirkt elektrochemisch und wandelt gebundene Energie eines Trägerstoffs direkt in elektrische Leistung um. Sie arbeitet nahezu geräuschlos, ist in elektrischer und thermischer Leistung flexibel an den tatsächlichen Bedarf anpassbar und reduziert die CO2-Emissionen gegenüber einem Verbrennungsmotor um bis zu 40 Prozent. Während konventionelle BHKWs Strom und Wärme nur durch regenerative oder fossile Brennstoffe erzeugen, kann eine Brennstoffzelle Strom auf direkten Weg produzieren und benötigt keinen Generator mehr. Die Nutzung von Brennstoffzellen steht auf dem deutschen Mark noch am Anfang, hat jedoch die Unterstützung der Politik: Die Bundesregierung hat die Forschungsarbeit zu dieser Technologie auf ein Zehnjahresprogramm erweitert.
